Вот краткое описание происходящего:
События происходят задолго до рождения основных героев аниме "Наруто" и вообще до создания скрытых деревень. Существуют пока отдельные кланы ниндзя(Учиха, Сенджу, Хьюга и др.). Биджу разгуливают на свободе(за исключением одного), Мадара и Хошираму только стали лидерами своих кланов. До предложения мира и создания деревень ещё далеко, а пока началась - Война Кланов.